来有两种说法。
其一。传统负责司&法&部&门的有三个：大理寺、刑部，和督察院，合称“三法司”。这些机构的大门，按照形制、礼法的要求，都只能是三开间（两根立柱之间为一开间）。与每个开间对应的则有两扇大门。这样，整个办公大厅合起来共有六扇门板。上至三法司，下至州县衙门，皆如此制。所以民间称呼衙役，捕快等以此称代指。
其二。野史称万历年间，朝廷成立了一个集武林高手、密探、名捕、杀手等于一体的秘密组织，专门处理国家级大案要案。这个机构很神秘，除了北面是墙，东、南、西三面，各开两扇门，遂得名——不过，个人管见，这个听听就得，别当真。
寺和庙。
寺，其实通“侍”，是指朝廷的一个服务部门，比如太仆寺、光禄寺、鸿胪寺，大理寺等。
汉朝白马驮佛经东归，还带来了一个（有的说俩）高僧，以及一尊释迦牟尼像。起初，朝廷便是在鸿胪寺接待。高僧留下传法，汉永明帝为了表示隆重，便在洛阳建白马寺——你看，这个新房子跟接待你的政府部门规格相同，也叫寺。白马寺也被亚洲其他国家的佛教徒称为“祖庭”。
庙，是祭祀先人的场所，比如太庙。太庙是皇族祭祀祖先的场所，在皇宫里。皇宫是皇族的内宅，除非咔嚓来一下，其他闲人免进。再比如孔庙，土地庙，家庙等。再后来敬拜佛祖观音等的场所，因为也有祭祀的含义，也就称庙了。
外面叫“堂”，朝堂。合起来便是内庙外堂，所以有个词叫“庙堂”，专指家国一体的内外朝廷。
庙是祭祀皇帝祖先的，寺是为现任皇帝服务的，所以，理论上来讲，庙的规格要比寺高。
但不管怎么说，白马寺是皇帝命名的高大上的称谓，所以后来佛家弟子修建的礼佛场所，都叫寺、到了百姓这里，看见香烟缭绕，就叫庙。至今，寺庙逐渐变成一个词了。