奏疏弹劾锦衣卫与山东按察司，无论结果如何，都不会再和他有关系，因为无论如何，那都是朝廷官员们之间的事。
孔闻韶相信只要锦衣卫查不到自己，自己也就不会有事。
但孔闻韶没有想到的是，在他还没放下心多久，戚勋就带着官兵包围了曲阜孔府。
孔闻韶很是惊愕：“戚总兵，你们这是干什么？”
“奉旨，剿灭逆贼孔闻韶一族！我说孔先生，你也胆子忒大了些，敢刺杀当今皇上！就算你不知道皇上当时在那队锦衣卫里，锦衣卫是天子亲军，你也不能想着灭口啊！”
戚勋这么一说，孔闻韶自然是什么都明白了，一时直接就软倒在地，喃喃自语起来：“皇上？皇上来山东了？这怎么可能！”
戚勋没说什么，只吩咐人把孔府围起来不许放走一个，毕竟他也是才从别人口中得知这事，一时也才明白为何自己收到一道要灭了孔府的圣旨。
而这时候，孔闻韶在稍微定了定神后就突然跪在了戚勋面前，而且直接痛哭了起来：“戚总兵，孔某真的很冤枉啊，孔某哪敢行刺皇上啊！戚总兵，您要明察啊，孔某乃是圣人后裔，何敢有如此不忠不臣之心啊！”
“圣旨已下，孔先生你也不必再狡辩了，再说，你们儒臣不是常说君要臣死臣不得不死吗，何必再强自狡辩！”
戚勋说着就将手一挥，大声喝道：“带走！”
同时，戚勋则拔出刀来，而这时候，孔闻泰也走了出来：“戚总兵，你这是要做什么？”
这孔闻泰话刚一落，戚勋就一刀捅了过去：“奉旨，处置谋逆乱贼！”
除了孔闻韶被押解进京严惩外，其余孔府嫡系族人皆被处决，而孔府嫡系族人之田地则分给曲阜其他孔姓庶民，同时，孔府所开之矿也全部被停。
朱厚照知道此事后没有多说什么，他也没想过还会把孔家处理到这一步，但他也没想到孔家会撞到自己要对民间私自开矿很是深恶痛绝的刀口上，而且还因为开矿奴役自己的族人，甚至私设严酷之族约，让朱厚照看到的不是一个有仁德的宗族而是一个吃人的黑势力集团。
但朱厚照不知道自己除掉一个孔家的同时，还有多少个和孔家一样扮演着人吃人的宗族存在。
孔家的矿业被禁后并非像贫瘠地区百姓们的矿业被禁一样会影响的当地百姓之生产，反而解放了当地的百姓，而且再加上朱厚照把孔家这么一除，当地百姓还有了足够的土地进行耕种，甚至因此缓解了山东地区的阶级矛
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