澳门总督这个职位放在葡萄牙内部，其实就相当于政府在外地的部长。
协助现任澳门总督亚马留的是澳门议事会以及保安部队司令，一般来说，现任澳门总督外出时，由保安司令出任“护督”，代为掌管租地。
除此之外，由于近期葡萄牙在西荷战争中的失败，导致葡萄牙本土实力大为下降，王室对澳门一带的控制力有所减弱，从而侧面助长了澳门总督一职的权利。
近些年来，葡萄牙被西班牙以及英国人联手攻击，远东殖民地又被荷兰人趁火打劫抢夺大片，现在为止，除了澳门还有成建制的葡萄牙部队以外，葡萄牙在远东的殖民地，实际上就只剩下了东帝汶一地。
话说回来，葡萄牙在澳门还仅仅只是暂住关系，除一小部分租地以外，澳门城内大片地区还是由明军驻扎掌管。
但是在东帝汶，这种情况就是完全不同，葡萄牙人拥有自己的皇家舰队和陆海军队，他们在东帝汶是真正的殖民。
澳门一地的主权依然还在明朝，也就是崇祯皇帝手中。
按理来说，澳门总督亚马留的职务所在，只是管理在澳门暂住的葡萄牙人，设立的法律和军令也仅仅只限于此。
葡萄牙由于陷入三十年内战，所以不想在这个节骨眼上与大明其冲突，历任澳督基本也都是规规矩矩。
但是从今年开始，新任的澳督亚马留开始涉足并且插手葡萄牙人在澳门暂租地以外的事务。
崇祯十八年二月底，亚马留经过长期准备，亲自动手抓走澳门海关总署内官员五名，并于今年三月初，对澳门的各有司衙门下达最后通牒，要求关闭海关总署。
时任两广总督的沈犹龙一方面向朝廷上疏，另一方面则前往澳门与亚马留交涉，然而亚马留早有准备，交涉自然无果。
事后，亚马留对沈犹龙回绝自己深为恼怒，亲自带兵前往澳门南环口，强行关闭朝廷在澳门的海关总署，并且抓走了当时总署内的全部官员。
四月中旬，沈犹龙的奏疏到达京师，这件事引起了兵部尚书张国维的高度重视，立即移交内阁。
当时还是半夜，魏藻德从蒋德璟口中听闻此事后吓了一跳，深恐皇帝震怒，立即召集阁臣连夜商议，在第二天上呈给崇祯皇帝。
经过京师朝议讨论，崇祯皇帝采纳群臣建议，降旨将居住在澳门的葡萄牙人租金提高十倍，也就是说，自今年开始，葡萄牙人若是还想在澳门借租，每年至少需要像明朝方面缴纳至少五千两的白银。
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