领旨之后，林墨立刻行动起来。南巡事关重大，皇帝的安危系于一身，他必须在出发之前，将沿途的安全保障工作，做到万无一失。
他首先从玄天宗中，挑选了五名最为出色的弟子，作为随行助手。这五人，都是入门两年以上、已经积累了丰富实战经验的佼佼者。其中两人擅长勘察地形和水文，两人精通罗盘和理气，还有一人则对各地的风土人情和民间传闻了如指掌。首席大弟子沈默，自然也在随行之列，负责统领这五人小组。
林墨又向钦天监和兵部，调取了大量关于京杭大运河沿线以及江南地区的地理图志、水文资料和历年气候记录。他带着五名弟子，在玄天宗的一间静室中，闭关研究了整整七天。他们将皇帝拟定的南巡路线，逐段进行分析，标记出所有可能存在安全隐患的地点。
“这里，扬州段，古运河与长江交汇处，水流湍急，暗涡众多，龙船经过时必须格外小心，最好选择在平潮时段通过。”林墨指着地图上的一处，对沈默等人说道。
“还有这里，苏州城外的一处芦苇荡，地形复杂，易于藏匿。需要提前派遣水师清理排查，并在龙船经过时，沿岸布置警戒。”另一名弟子补充道。
“杭州的钱塘江，每年秋季都有大潮，虽然壮观，但也极其危险。陛下的行程，必须避开潮汛期。”负责水文资料的弟子也提出了自己的看法。
七天后，一份详尽的《南巡沿途安全风险评估报告》，被呈送到了皇帝的御案上。报告中，不仅详细列出了沿途各处的地理特点和潜在风险，还提出了相应的应对预案。甚至对沿途哪些府县的官员较为清廉可靠、哪些地方可能存在吏治问题，林墨也根据自己的了解和玄天宗弟子反馈的信息，做了谨慎的备注。
皇帝看完这份报告，对林墨的缜密和细致，大加赞赏。他当即批示，将这份报告作为南巡行动的纲领性文件，下发到相关各部门，要求严格执行。
在出发前的一个月，林墨又亲自带领沈默等几名弟子，以及一队禁军精锐，沿着南巡的既定路线，进行了一次实地预演。他们轻装简从，日夜兼程，每到一处预定驻跸的地点，林墨都会亲自登上高处，察看当地的山川形势，用罗盘测定方位，评估行宫选址的安全性。
在扬州，他否定了当地官员推荐的、一处位于河边低洼地带的行宫选址，指出那里虽然风景优美，但地势过低，一旦遇到暴雨，极易被淹。他重新选择了一处地势较高、背山面水、格局开阔的地方，作为皇帝驻跸扬州时的行宫。
…。。